Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FDXR-212ENST00000580492 553 ntTSL 524.95■■□□□ 1.582e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FDXR-215ENST00000581969 568 ntTSL 424.49■■□□□ 1.512e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 RNF40-210ENST00000566811 569 ntTSL 224.33■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.462e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 THRB-210ENST00000447414 575 ntTSL 423.91■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SLC25A32-205ENST00000523866 1347 ntTSL 223.82■■□□□ 1.42e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FBXL19-206ENST00000562798 299 ntTSL 422.91■■□□□ 1.262e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 422.56■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-222ENST00000497144 598 ntTSL 422.3■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 THRB-204ENST00000413780 896 ntTSL 322.13■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-221ENST00000568366 767 ntTSL 421.75■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 RNF40-205ENST00000563909 711 ntTSL 321.73■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PI4KA-203ENST00000449120 574 ntTSL 421.67■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TYK2-204ENST00000525220 583 ntTSL 421.38■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 221.19■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PTPRA-206ENST00000430705 733 ntTSL 521.04■□□□□ 0.962e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 THRB-212ENST00000453729 703 ntTSL 1 (best)20.68■□□□□ 0.92e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 220.6■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-203ENST00000411783 915 ntTSL 319.79■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 DTD1-202ENST00000494921 2384 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 CPVL-212ENST00000488891 696 ntTSL 519.26■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-204ENST00000416579 895 ntTSL 318.84■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 218.82■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 HPS1-214ENST00000498219 845 ntTSL 518.36■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 DTD1-203ENST00000618693 695 ntTSL 517.93■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SLC25A32-203ENST00000523256 2711 ntTSL 517.85■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SLC25A32-202ENST00000521645 2815 ntTSL 517.44■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 GCN1-206ENST00000549815 543 ntTSL 317.25■□□□□ 0.356e-7■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 THRB-207ENST00000418247 592 ntTSL 216.84■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 KEAP1-204ENST00000588024 576 ntTSL 416.76■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 316.44■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 IGF2BP1-203ENST00000499130 568 ntTSL 316.25■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-11■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PPP6R1-205ENST00000589343 904 ntTSL 215.72■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 KMT2C-207ENST00000452749 479 ntTSL 515.65■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 215.6■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 LETM1-204ENST00000510940 563 ntTSL 215.56■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 1106 ntTSL 215.55■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 HPS1-212ENST00000480020 795 ntTSL 515.32■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-212ENST00000475630 422 ntTSL 314.95□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 576 ntTSL 214.89□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 CALN1-205ENST00000431984 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ZNF83-213ENST00000598536 522 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-205ENST00000442582 489 ntTSL 314.04□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-206ENST00000450185 2975 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ZNF83-218ENST00000601257 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-207ENST00000461352 3578 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ODF2-216ENST00000483070 723 ntTSL 513.32□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 CPVL-207ENST00000448959 874 ntTSL 213.27□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 22.7
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 90.8 ms