RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438298.6

TRAF3IP2-AS1-202, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 1,106 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.96■■■□□ 2.39
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NACADO15069 1562 aa25.5■■□□□ 1.67
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SCRIBQ14160 1630 aa24.51■■□□□ 1.51
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.44■■□□□ 1.34
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SMARCA2P51531 1590 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ERCC6Q03468 1493 aa23.34■■□□□ 1.33
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NESP48681 1621 aa23.18■■□□□ 1.3
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 WIZO95785 1651 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 WDR62O43379 1518 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CFTRP13569 1480 aa22.54■■□□□ 1.2
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TRIM41Q8WV44 630 aa22.36■■□□□ 1.17
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 IFT140Q96RY7 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TOPBP1Q92547 1522 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 POTEDQ86YR6 584 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.03■■□□□ 1.12
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.94■■□□□ 1.1
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ARHGEF11O15085 1522 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
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TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CHD1O14646 1710 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ADRA2BP18089 450 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SOGA1O94964 1423 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FBLN2P98095 1184 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 WDR97A6NE52 1622 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CUX1P39880 1505 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ARAP1Q96P48 1450 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GRIN2BQ13224 1484 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SYNJ1O43426 1573 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SYNJ2O15056 1496 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PBRM1Q86U86 1689 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TOP2BQ02880 1626 aa21.33■■□□□ 1
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.33■■□□□ 1
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GRIN2AQ12879 1464 aa21.32■■□□□ 1
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