Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.024e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.32e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 IRF9-201ENST00000324076 658 ntTSL 510.77□□□□□ -0.694e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 IRF9-208ENST00000560311 648 ntTSL 25.88□□□□□ -1.474e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 WTAP-203ENST00000462110 584 ntTSL 29.44□□□□□ -0.92e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PPWD1-210ENST00000513773 955 ntTSL 26.69□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PPWD1-208ENST00000511334 562 ntTSL 45.15□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PPWD1-211ENST00000514172 596 ntTSL 34.77□□□□□ -1.652e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PPWD1-212ENST00000515151 534 ntTSL 34.13□□□□□ -1.752e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 SLC22A18-212ENST00000498209 782 ntTSL 312.9□□□□□ -0.341e-10■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 BTBD19-204ENST00000464114 505 ntTSL 320.81■□□□□ 0.921e-11■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 BTBD19-208ENST00000489976 539 ntTSL 219.89■□□□□ 0.771e-11■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.347e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.017e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.187e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NUP58-203ENST00000381747 1659 ntTSL 516.62■□□□□ 0.252e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NUP58-208ENST00000466694 1854 ntTSL 514.95□□□□□ -0.022e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NUP58-204ENST00000394327 1408 ntTSL 55.63□□□□□ -1.512e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NUP58-209ENST00000476553 564 ntTSL 45□□□□□ -1.612e-9■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 ARID4A-205ENST00000424658 582 ntTSL 222.84■■□□□ 1.254e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ARID4A-207ENST00000431612 697 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.774e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ARID4A-208ENST00000445108 965 ntTSL 318.06■□□□□ 0.484e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 APRT-210ENST00000568575 490 ntTSL 211.7□□□□□ -0.549e-8■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 APRT-206ENST00000567057 437 ntTSL 210.25□□□□□ -0.779e-8■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PRR5-208ENST00000455389 1431 ntTSL 316.32■□□□□ 0.24e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PRR5-215ENST00000495017 2125 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 04e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-206ENST00000503660 1071 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10.8
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SF3B4Q15427 G3BP2-219ENST00000515457 560 ntTSL 413.44□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-218ENST00000513927 426 ntTSL 311.11□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-208ENST00000507252 567 ntTSL 49.79□□□□□ -0.842e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-204ENST00000499709 508 ntTSL 49.7□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-217ENST00000511868 573 ntTSL 29.12□□□□□ -0.952e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-210ENST00000507745 584 ntTSL 47.95□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-216ENST00000511146 577 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-214ENST00000509561 559 ntTSL 46.35□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-212ENST00000508510 554 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 G3BP2-213ENST00000509100 514 ntTSL 54.5□□□□□ -1.692e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RSRC2-210ENST00000526560 545 ntTSL 411.13□□□□□ -0.634e-8■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RSRC2-213ENST00000527461 711 ntTSL 311.02□□□□□ -0.654e-8■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RSRC2-218ENST00000531639 522 ntTSL 23.84□□□□□ -1.794e-8■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.89■□□□□ 0.777e-22■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-215ENST00000523335 1540 ntTSL 215.9■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-212ENST00000522407 541 ntTSL 414.75□□□□□ -0.052e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-203ENST00000517350 2150 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.382e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-204ENST00000517756 445 ntTSL 510.79□□□□□ -0.682e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-210ENST00000521662 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.812e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-214ENST00000522766 567 ntTSL 49.99□□□□□ -0.812e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-202ENST00000517311 2966 ntTSL 28.86□□□□□ -0.992e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-201ENST00000339942 546 ntTSL 48.38□□□□□ -1.072e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-209ENST00000521619 1384 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.582e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ENY2-216ENST00000523707 737 ntTSL 54.63□□□□□ -1.672e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 U2SURP-213ENST00000491827 824 ntTSL 33.69□□□□□ -1.822e-7■□□□□ 10.8
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SF3B4Q15427 SAPCD1-211ENST00000494299 574 ntTSL 312.03□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-215ENST00000522721 601 ntTSL 421.09■□□□□ 0.972e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-218ENST00000523740 983 ntTSL 319.03■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-212ENST00000521787 561 ntTSL 417.79■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-214ENST00000522315 563 ntTSL 416.28■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-211ENST00000521554 858 ntTSL 214.23□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-207ENST00000519453 560 ntTSL 414.16□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SORBS3-219ENST00000523900 670 ntTSL 313.17□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TM4SF1-203ENST00000493298 702 ntTSL 47.9□□□□□ -1.147e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TM4SF1-204ENST00000493348 976 ntTSL 27.44□□□□□ -1.227e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.277e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.727e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RBMX-206ENST00000561733 837 ntTSL 39.29□□□□□ -0.921e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RBMX-205ENST00000496459 2041 ntTSL 25.6□□□□□ -1.511e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 318.3■□□□□ 0.524e-8■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 514.78□□□□□ -0.044e-8■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SURF4-204ENST00000465565 400 ntTSL 317.97■□□□□ 0.474e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SCART1-203ENST00000475114 946 ntTSL 213.78□□□□□ -0.24e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 WDR13-207ENST00000482760 562 ntTSL 312.48□□□□□ -0.418e-11■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RICTOR-204ENST00000505927 570 ntTSL 26.47□□□□□ -1.374e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ZCCHC7-204ENST00000463625 732 ntTSL 25.08□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-217ENST00000470826 2281 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.778e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-223ENST00000496296 1898 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.628e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-237ENST00000532386 725 ntTSL 312.86□□□□□ -0.358e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-221ENST00000484370 826 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.458e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-226ENST00000525001 1155 ntTSL 512.07□□□□□ -0.488e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-218ENST00000474970 764 ntTSL 512□□□□□ -0.498e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-231ENST00000527203 556 ntTSL 310.37□□□□□ -0.758e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-234ENST00000530568 467 ntTSL 39.25□□□□□ -0.938e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-229ENST00000526742 657 ntTSL 48.8□□□□□ -18e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-233ENST00000529552 688 ntTSL 48.43□□□□□ -1.068e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FGFR1-240ENST00000533668 571 ntTSL 57.46□□□□□ -1.228e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-215ENST00000595055 556 ntTSL 222.24■■□□□ 1.152e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.032e-7■□□□□ 10.8
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