RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424658.5

ARID4A-205, Transcript of AT-rich interaction domain 4A, humanhuman

TSL 2

Gene ARID4A, Length 582 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4A-205ENST00000424658 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.68■■■■■ 7.62
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ARID4A-205ENST00000424658 ABCC9O60706 1549 aa55.9■■■■■ 6.54
ARID4A-205ENST00000424658 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.39■■■■■ 6.14
ARID4A-205ENST00000424658 NACADO15069 1562 aa53.1■■■■■ 6.09
ARID4A-205ENST00000424658 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.57■■■■■ 6.01
ARID4A-205ENST00000424658 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.51■■■■■ 6
ARID4A-205ENST00000424658 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.3■■■■■ 5.96
ARID4A-205ENST00000424658 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.24■■■■■ 5.95
ARID4A-205ENST00000424658 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.01■■■■■ 5.92
ARID4A-205ENST00000424658 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52■■■■■ 5.92
ARID4A-205ENST00000424658 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.88■■■■■ 5.9
ARID4A-205ENST00000424658 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.86■■■■■ 5.89
ARID4A-205ENST00000424658 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.26■■■■■ 5.8
ARID4A-205ENST00000424658 SCRIBQ14160 1630 aa51.12■■■■■ 5.77
ARID4A-205ENST00000424658 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.59■■■■■ 5.69
ARID4A-205ENST00000424658 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
ARID4A-205ENST00000424658 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.39■■■■■ 5.66
ARID4A-205ENST00000424658 NCAPD3P42695 1498 aa49.01■■■■■ 5.44
ARID4A-205ENST00000424658 SMARCA4P51532 1647 aa48.86■■■■■ 5.41
ARID4A-205ENST00000424658 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.86■■■■■ 5.41
ARID4A-205ENST00000424658 SMARCA2P51531 1590 aa48.75■■■■■ 5.39
ARID4A-205ENST00000424658 HMGXB3Q12766 1538 aa48.68■■■■■ 5.38
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ARID4A-205ENST00000424658 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.47■■■■■ 5.35
ARID4A-205ENST00000424658 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
ARID4A-205ENST00000424658 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.26■■■■■ 5.32
ARID4A-205ENST00000424658 ERCC6Q03468 1493 aa48.24■■■■■ 5.31
ARID4A-205ENST00000424658 CUX2O14529 1486 aa48.22■■■■■ 5.31
ARID4A-205ENST00000424658 NESP48681 1621 aa48.09■■■■■ 5.29
ARID4A-205ENST00000424658 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.95■■■■■ 5.27
ARID4A-205ENST00000424658 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.88■■■■■ 5.26
ARID4A-205ENST00000424658 WIZO95785 1651 aa47.69■■■■■ 5.22
ARID4A-205ENST00000424658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
ARID4A-205ENST00000424658 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.55■■■■■ 5.2
ARID4A-205ENST00000424658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.54■■■■■ 5.2
ARID4A-205ENST00000424658 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.49■■■■■ 5.19
ARID4A-205ENST00000424658 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.32■■■■■ 5.17
ARID4A-205ENST00000424658 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
ARID4A-205ENST00000424658 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.13■■■■■ 5.13
ARID4A-205ENST00000424658 WDR62O43379 1518 aa47.05■■■■■ 5.12
ARID4A-205ENST00000424658 CFTRP13569 1480 aa47.02■■■■■ 5.12
ARID4A-205ENST00000424658 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.96■■■■■ 5.11
ARID4A-205ENST00000424658 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.93■■■■■ 5.1
ARID4A-205ENST00000424658 PRDM2Q13029 1718 aa46.63■■■■■ 5.06
ARID4A-205ENST00000424658 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.57■■■■■ 5.04
ARID4A-205ENST00000424658 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
ARID4A-205ENST00000424658 TOPBP1Q92547 1522 aa46.08■■■■■ 4.97
ARID4A-205ENST00000424658 IFT140Q96RY7 1462 aa46.04■■■■■ 4.96
ARID4A-205ENST00000424658 ABCC8Q09428 1581 aa46.03■■■■■ 4.96
ARID4A-205ENST00000424658 OSCARQ8IYS5 282 aa45.96■■■■■ 4.95
ARID4A-205ENST00000424658 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.94■■■■■ 4.94
ARID4A-205ENST00000424658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
ARID4A-205ENST00000424658 TRIM41Q8WV44 630 aa45.75■■■■■ 4.91
ARID4A-205ENST00000424658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
ARID4A-205ENST00000424658 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
ARID4A-205ENST00000424658 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
ARID4A-205ENST00000424658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.87
ARID4A-205ENST00000424658 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.4■■■■■ 4.86
ARID4A-205ENST00000424658 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.4■■■■■ 4.86
ARID4A-205ENST00000424658 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.4■■■■■ 4.86
ARID4A-205ENST00000424658 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.39■■■■■ 4.86
ARID4A-205ENST00000424658 SOGA1O94964 1423 aa45.37■■■■■ 4.85
ARID4A-205ENST00000424658 CHD1O14646 1710 aa45.35■■■■■ 4.85
ARID4A-205ENST00000424658 CUX1P39880 1505 aa45.34■■■■■ 4.85
ARID4A-205ENST00000424658 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.33■■■■■ 4.85
ARID4A-205ENST00000424658 WDR97A6NE52 1622 aa45.31■■■■■ 4.84
ARID4A-205ENST00000424658 ARHGEF11O15085 1522 aa45.26■■■■■ 4.84
ARID4A-205ENST00000424658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
ARID4A-205ENST00000424658 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
ARID4A-205ENST00000424658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.05■■■■■ 4.8
ARID4A-205ENST00000424658 FBLN2P98095 1184 aa45.05■■■■■ 4.8
ARID4A-205ENST00000424658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
ARID4A-205ENST00000424658 GRIN2BQ13224 1484 aa44.99■■■■■ 4.79
ARID4A-205ENST00000424658 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.89■■■■■ 4.78
ARID4A-205ENST00000424658 PBRM1Q86U86 1689 aa44.86■■■■■ 4.77
ARID4A-205ENST00000424658 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.86■■■■■ 4.77
ARID4A-205ENST00000424658 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.85■■■■■ 4.77
ARID4A-205ENST00000424658 SYNJ2O15056 1496 aa44.84■■■■■ 4.77
ARID4A-205ENST00000424658 ARAP1Q96P48 1450 aa44.83■■■■■ 4.77
ARID4A-205ENST00000424658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
ARID4A-205ENST00000424658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.82■■■■■ 4.77
ARID4A-205ENST00000424658 SYNJ1O43426 1573 aa44.82■■■■■ 4.76
ARID4A-205ENST00000424658 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.81■■■■■ 4.76
ARID4A-205ENST00000424658 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.72■■■■■ 4.75
ARID4A-205ENST00000424658 TOP2BQ02880 1626 aa44.7■■■■■ 4.75
ARID4A-205ENST00000424658 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.68■■■■■ 4.74
ARID4A-205ENST00000424658 ADAMTS12P58397 1594 aa44.43■■■■■ 4.7
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ARID4A-205ENST00000424658 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.34■■■■■ 4.69
ARID4A-205ENST00000424658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.3■■■■■ 4.68
ARID4A-205ENST00000424658 NUP160Q12769 1436 aa44.3■■■■■ 4.68
ARID4A-205ENST00000424658 CEP170Q5SW79 1584 aa44.26■■■■■ 4.68
ARID4A-205ENST00000424658 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
ARID4A-205ENST00000424658 SHROOM2Q13796 1616 aa44.13■■■■■ 4.65
ARID4A-205ENST00000424658 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.1■■■■■ 4.65
ARID4A-205ENST00000424658 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.82■■■■■ 4.61
ARID4A-205ENST00000424658 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
ARID4A-205ENST00000424658 KIF27Q86VH2 1401 aa43.77■■■■■ 4.6
ARID4A-205ENST00000424658 JPH4Q96JJ6 628 aa43.76■■■■■ 4.6
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