Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms