Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-228ENST00000487962 2024 ntTSL 214.02□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PKD1-213ENST00000480227 2353 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.25e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PKD1-224ENST00000561991 964 ntTSL 513.47□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TRMT11-209ENST00000479748 2093 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-208ENST00000476957 910 ntTSL 313.31□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 513.2□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PKD1-225ENST00000562297 2040 ntTSL 513.19□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PKD1-234ENST00000567946 1822 ntTSL 513.06□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-205ENST00000471142 544 ntTSL 413.02□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-212ENST00000496999 775 ntTSL 212.99□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PKD1-222ENST00000496574 4419 ntTSL 512.4□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 28.3
SUB1P53999 ACADVL-218ENST00000579391 341 ntTSL 212.13□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-209ENST00000481885 516 ntTSL 312.08□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-230ENST00000494699 797 ntTSL 212.02□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-204ENST00000461363 856 ntTSL 212.01□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 BCORL1-203ENST00000456822 5648 ntTSL 511.96□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PKD1-219ENST00000486339 4443 ntTSL 511.83□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RCHY1-213ENST00000514589 2443 ntTSL 211.8□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MRPS34-203ENST00000569585 713 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 ZW10-202ENST00000535142 2735 ntTSL 211.11□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 28.3
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SUB1P53999 PKD1-202ENST00000415938 3386 ntTSL 510.88□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 28.3
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SUB1P53999 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 28.3
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SUB1P53999 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 UBA3-203ENST00000415609 2004 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-209ENST00000478532 945 ntTSL 59.82□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-206ENST00000375479 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CPSF4-210ENST00000469897 689 ntTSL 29.74□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-204ENST00000375459 1668 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 LRRD1-202ENST00000422722 3511 ntTSL 29.62□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-213ENST00000497973 667 ntTSL 29.46□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CTDSPL-202ENST00000310189 1482 ntTSL 59.2□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CLPX-204ENST00000559152 2228 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-207ENST00000477328 596 ntTSL 29.07□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.985e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.984e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.994e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PNPT1-205ENST00000447944 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-216ENST00000622406 1937 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.025e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.025e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PSMG2-207ENST00000586587 711 ntTSL 38.52□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 GCN1-202ENST00000547263 366 ntTSL 38.25□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DOCK2-207ENST00000519868 4361 ntTSL 28.19□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-207ENST00000462653 669 ntTSL 1 (best)8.18□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DNAJA2-202ENST00000563158 1825 ntTSL 58.15□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PSMG2-208ENST00000588824 794 ntTSL 28.1□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 28.3
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