Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COLCA2A8K830 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COLCA2A8K830 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms