Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 MOB1B-205ENST00000511449 627 ntTSL 318.7■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.372e-9■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 ALDOA-224ENST00000568435 935 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.542e-8■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 ALDOA-223ENST00000567555 554 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 ALDOA-216ENST00000566012 553 ntTSL 514.92□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 525.66■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 524.69■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 414.3□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 57.49□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 33.2
SF3B1O75533 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 33.1
SF3B1O75533 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 33.1
SF3B1O75533 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 220.2■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 33.1
SF3B1O75533 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 33.1
SF3B1O75533 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 213.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 33.1
SF3B1O75533 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 33.1
SF3B1O75533 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 33
SF3B1O75533 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 33
SF3B1O75533 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 33
SF3B1O75533 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 33
SF3B1O75533 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 33
SF3B1O75533 RINT1-208ENST00000497979 2627 ntTSL 511.43□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 33
SF3B1O75533 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 CPED1-205ENST00000443817 1118 ntTSL 1 (best)4.83□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 512.3□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 ZNF692-217ENST00000495731 461 ntTSL 330.04■■■□□ 2.47e-7■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 ZNF692-226ENST00000533647 548 ntTSL 324.41■■□□□ 1.57e-7■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 ZNF692-224ENST00000530986 595 ntTSL 422.48■■□□□ 1.197e-7■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 ZNF692-219ENST00000496231 656 ntTSL 322.24■■□□□ 1.157e-7■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 ZNF692-221ENST00000497847 1031 ntTSL 220.08■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 ZNF692-222ENST00000528141 576 ntTSL 418.7■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 RBM33-209ENST00000440108 1027 ntTSL 519.41■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 210.99□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 H3F3A-202ENST00000366814 1863 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 32.9
SF3B1O75533 GPCPD1-206ENST00000481690 819 ntTSL 324.44■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 RPL12-204ENST00000497825 864 ntTSL 219.42■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 RPL12-203ENST00000497322 2275 ntTSL 216.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 RPL12-205ENST00000536368 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 LEPROT-202ENST00000475108 492 ntTSL 323.88■■□□□ 1.412e-7■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 LEPROT-204ENST00000488747 345 ntTSL 511.52□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 32.8
SF3B1O75533 WDR43-204ENST00000440983 541 ntTSL 43□□□□□ -1.932e-7■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 RPS21-204ENST00000450116 418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.513e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 ACSL3-209ENST00000535678 560 ntTSL 321.91■■□□□ 1.15e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-206ENST00000473527 1005 ntTSL 1 (best)20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-208ENST00000480497 530 ntTSL 318.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-209ENST00000482199 731 ntTSL 318.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-204ENST00000449367 745 ntTSL 217.98■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.25e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-202ENST00000435848 692 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 LONP1-207ENST00000588589 684 ntTSL 215.48■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.058e-10■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.228e-10■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 SRP54-213ENST00000556994 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.548e-10■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 SRP54-208ENST00000555557 1949 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.688e-10■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 FIS1-205ENST00000463406 527 ntTSL 310.06□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 TVP23C-208ENST00000581273 488 ntTSL 37.67□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 SRP54-212ENST00000556992 529 ntTSL 24.55□□□□□ -1.688e-10■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 STAM-204ENST00000486183 274 ntTSL 31.33□□□□□ -2.22e-11■■■■■ 32.7
SF3B1O75533 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-204ENST00000311420 1583 ntTSL 511.84□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-222ENST00000523991 505 ntTSL 1 (best)9.65□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.066e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-213ENST00000393417 1683 ntTSL 58.37□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-212ENST00000393416 754 ntTSL 57.88□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-211ENST00000393415 842 ntTSL 56.76□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-225ENST00000539479 845 ntTSL 1 (best)6.56□□□□□ -1.366e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-224ENST00000537182 1011 ntTSL 1 (best)5.82□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.526e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-234ENST00000546048 363 ntTSL 55.48□□□□□ -1.536e-7■■■■■ 32.6
SF3B1O75533 MDM2-230ENST00000543323 427 ntTSL 1 (best)5.03□□□□□ -1.66e-7■■■■■ 32.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3332.3 ms