Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3Q12983 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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