Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SRM-202ENST00000459997 731 ntTSL 522.95■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 36.3
SF3B1O75533 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 217.26■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 36.3
SF3B1O75533 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 211.33□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 36.3
SF3B1O75533 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 510.55□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 36.3
SF3B1O75533 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.124e-21■■■■■ 36.3
SF3B1O75533 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-21■■■■■ 36.3
SF3B1O75533 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 36.2
SF3B1O75533 QSER1-203ENST00000527250 448 ntTSL 31.46□□□□□ -2.182e-6■■■■■ 36.2
SF3B1O75533 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 224.2■■□□□ 1.464e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.374e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 215.49■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATP5A1-218ENST00000592364 576 ntTSL 513.36□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 MYRF-204ENST00000536352 1067 ntTSL 519.53■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 MYRF-205ENST00000537318 1844 ntTSL 217.69■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 LARP1B-207ENST00000507377 1593 ntTSL 29.78□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 LARP1B-202ENST00000394288 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 36.1
SF3B1O75533 SSX2IP-202ENST00000422026 759 ntTSL 315.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 219.77■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.823e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.733e-6■■■■■ 36
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SF3B1O75533 UBE2E3-207ENST00000602499 744 ntTSL 223.74■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-203ENST00000602291 766 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-210ENST00000602762 340 ntTSL 38.58□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-204ENST00000602303 654 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 UBE2E3-212ENST00000602888 499 ntTSL 23.14□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.218e-7■■■■■ 36
SF3B1O75533 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.078e-7■■■■■ 36
SF3B1O75533 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 218■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 36
SF3B1O75533 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 36
SF3B1O75533 FAF2-205ENST00000510730 684 ntTSL 321.16■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 36
SF3B1O75533 FAF2-204ENST00000510446 756 ntTSL 36.97□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 36
SF3B1O75533 ERBIN-206ENST00000503913 544 ntTSL 36.2□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 EPB41-212ENST00000490308 354 ntTSL 32.64□□□□□ -1.995e-7■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 FADS1-208ENST00000473263 574 ntTSL 422.87■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 TLE3-217ENST00000559574 325 ntTSL 520.28■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 TXNRD1-220ENST00000529751 557 ntTSL 419.21■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 DKC1-208ENST00000475423 587 ntTSL 218.21■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 35.9
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SF3B1O75533 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.355e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 TXNRD1-221ENST00000529784 607 ntTSL 414.46□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 FADS1-205ENST00000448607 559 ntTSL 413.15□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 PSMC3-205ENST00000528362 546 ntTSL 212.88□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 35.9
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SF3B1O75533 TXNRD1-213ENST00000526580 400 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 TXNRD1-218ENST00000528079 629 ntTSL 49.38□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 58.45□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.485e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.535e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.665e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 PAPD4-214ENST00000513735 600 ntTSL 54□□□□□ -1.775e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.845e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 PAPD4-208ENST00000504982 600 ntTSL 21.99□□□□□ -2.095e-6■■■■■ 35.9
SF3B1O75533 CDC42SE1-203ENST00000470278 939 ntTSL 516.15■□□□□ 0.189e-7■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 CDC42SE1-206ENST00000492796 1174 ntTSL 211.63□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 CDC42SE1-204ENST00000483763 2379 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.079e-7■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 SLC3A2-210ENST00000537839 584 ntTSL 511.63□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 519.42■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 230.41■■■□□ 2.461e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 530.41■■■□□ 2.461e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 528.83■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 228.83■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 328.83■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 527.64■■■□□ 2.011e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 227.62■■■□□ 2.011e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 527.38■■□□□ 1.971e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.861e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.861e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-233ENST00000476935 828 ntTSL 326.06■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)25.42■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-248ENST00000488652 953 ntTSL 523.36■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 521.22■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 520.78■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 520.21■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 35.8
SF3B1O75533 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 319.87■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 35.8
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