Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 NGLY1-213ENST00000489271 2288 ntTSL 1 (best)4.47□□□□□ -1.694e-6■■■■□ 26.1
BUD13Q9BRD0 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 515.36■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-210ENST00000485424 652 ntTSL 215.62■□□□□ 0.094e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-207ENST00000465108 804 ntTSL 215.48■□□□□ 0.074e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-209ENST00000466763 622 ntTSL 215.48■□□□□ 0.074e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-205ENST00000461934 1224 ntTSL 215.47■□□□□ 0.074e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.134e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.144e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.254e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-203ENST00000415609 2004 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-211ENST00000493957 581 ntTSL 313.13□□□□□ -0.314e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 UBA3-208ENST00000465627 1388 ntTSL 29.4□□□□□ -0.94e-10■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 56.96□□□□□ -1.37e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 PPP1R13L-204ENST00000587270 2512 ntTSL 1 (best)20.74■□□□□ 0.914e-9■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-203ENST00000381747 1659 ntTSL 519.9■□□□□ 0.783e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-213ENST00000490231 563 ntTSL 418.49■□□□□ 0.553e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-208ENST00000466694 1854 ntTSL 518.25■□□□□ 0.513e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-214ENST00000495460 947 ntTSL 517.84■□□□□ 0.453e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.393e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-9■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-205ENST00000460326 582 ntTSL 215.97■□□□□ 0.153e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-207ENST00000465068 551 ntTSL 415.23■□□□□ 0.033e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.014e-9■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 XRCC3-208ENST00000554811 3668 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.513e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 BBX-219ENST00000457496 556 ntTSL 410.07□□□□□ -0.85e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 ITPR2-205ENST00000538984 586 ntTSL 38.98□□□□□ -0.971e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 BBX-210ENST00000429270 539 ntTSL 48.52□□□□□ -1.055e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 MAPK13-204ENST00000476951 499 ntTSL 38.48□□□□□ -1.052e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 BBX-213ENST00000449213 843 ntTSL 58.29□□□□□ -1.085e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 NUP58-204ENST00000394327 1408 ntTSL 56.75□□□□□ -1.333e-14■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 BBX-214ENST00000449271 552 ntTSL 42.82□□□□□ -1.965e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 PKD1-205ENST00000469241 659 ntTSL 224.21■■□□□ 1.477e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.449e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.269e-8■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-207ENST00000481352 1725 ntTSL 516.9■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-204ENST00000423780 418 ntTSL 514.85□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.045e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-206ENST00000455605 1882 ntTSL 513.97□□□□□ -0.175e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-208ENST00000488601 973 ntTSL 28.55□□□□□ -1.045e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 POLR1C-205ENST00000428025 576 ntTSL 44.07□□□□□ -1.765e-7■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 PRKAB1-203ENST00000537400 555 ntTSL 315.38■□□□□ 0.057e-12■■■■□ 26
BUD13Q9BRD0 GATA2-205ENST00000492608 844 ntTSL 322.65■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 221.95■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 BRD8-222ENST00000506167 1363 ntTSL 511.25□□□□□ -0.613e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 PCK1-204ENST00000475833 1037 ntTSL 214.54□□□□□ -0.085e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.134e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.384e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 ANKRD36-206ENST00000620383 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 DPY30-204ENST00000422413 601 ntTSL 319.98■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 DPY30-205ENST00000430665 524 ntTSL 515.5■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 DPY30-203ENST00000414013 523 ntTSL 315.11■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 DPY30-207ENST00000452582 637 ntTSL 312.53□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 513.57□□□□□ -0.245e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 CRNKL1-204ENST00000490910 4183 ntTSL 1 (best)12.28□□□□□ -0.444e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.834e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.954e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 CRNKL1-205ENST00000496549 4093 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.974e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -14e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 RAB17-211ENST00000487008 558 ntTSL 317.96■□□□□ 0.471e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 POLE-205ENST00000503265 1501 ntTSL 422■■□□□ 1.115e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 CACTIN-208ENST00000591726 699 ntTSL 521.61■■□□□ 1.052e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.872e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 GRK2-206ENST00000527176 970 ntTSL 217.68■□□□□ 0.428e-9■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 CORO7-221ENST00000573773 934 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 GRK2-211ENST00000532099 886 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 GRK2-205ENST00000526572 789 ntTSL 314.4□□□□□ -0.12e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 GRK2-208ENST00000529815 589 ntTSL 213.3□□□□□ -0.283e-8■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 NDST2-207ENST00000639645 2448 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 EMC1-211ENST00000488681 562 ntTSL 311.69□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 NDST2-201ENST00000299641 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 NDST2-205ENST00000463410 461 ntTSL 311.39□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 25.9
BUD13Q9BRD0 STK11-202ENST00000585465 3554 ntTSL 514.78□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ABCA7-211ENST00000529442 520 ntTSL 412.67□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 KIAA0895L-207ENST00000563918 798 ntTSL 220.53■□□□□ 0.884e-8■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.493e-16■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.163e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 UNKL-212ENST00000511095 924 ntTSL 421.83■■□□□ 1.093e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 25.8
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