Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZBED5Q49AG3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED5Q49AG3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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