Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELOBQ15370 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms