Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELOBQ15370 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ELOBQ15370 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ELOBQ15370 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ELOBQ15370 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ELOBQ15370 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ELOBQ15370 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ELOBQ15370 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELOBQ15370 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELOBQ15370 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELOBQ15370 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ELOBQ15370 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ELOBQ15370 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ELOBQ15370 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELOBQ15370 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELOBQ15370 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELOBQ15370 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELOBQ15370 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELOBQ15370 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELOBQ15370 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELOBQ15370 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELOBQ15370 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELOBQ15370 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOBQ15370 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOBQ15370 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELOBQ15370 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELOBQ15370 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELOBQ15370 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELOBQ15370 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELOBQ15370 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELOBQ15370 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELOBQ15370 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELOBQ15370 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELOBQ15370 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ELOBQ15370 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ELOBQ15370 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ELOBQ15370 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ELOBQ15370 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ELOBQ15370 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELOBQ15370 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELOBQ15370 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELOBQ15370 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELOBQ15370 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELOBQ15370 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELOBQ15370 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ELOBQ15370 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ELOBQ15370 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ELOBQ15370 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELOBQ15370 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELOBQ15370 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELOBQ15370 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELOBQ15370 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELOBQ15370 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ELOBQ15370 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELOBQ15370 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELOBQ15370 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELOBQ15370 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELOBQ15370 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELOBQ15370 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELOBQ15370 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELOBQ15370 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELOBQ15370 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELOBQ15370 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELOBQ15370 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELOBQ15370 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELOBQ15370 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOBQ15370 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOBQ15370 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELOBQ15370 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELOBQ15370 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELOBQ15370 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELOBQ15370 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELOBQ15370 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELOBQ15370 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELOBQ15370 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELOBQ15370 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ELOBQ15370 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELOBQ15370 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELOBQ15370 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELOBQ15370 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELOBQ15370 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOBQ15370 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELOBQ15370 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELOBQ15370 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELOBQ15370 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELOBQ15370 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELOBQ15370 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ELOBQ15370 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELOBQ15370 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELOBQ15370 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELOBQ15370 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELOBQ15370 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELOBQ15370 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms