Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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