Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 TMEM248-206ENST00000484751 739 ntTSL 28.18□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 EXOC4-219ENST00000486013 1600 ntTSL 58.97□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 EXOC4-220ENST00000486409 605 ntTSL 46.39□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 EMID1-207ENST00000435427 482 ntTSL 526.1■■□□□ 1.775e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.765e-7■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 EMID1-204ENST00000429226 769 ntTSL 523.83■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.295e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 EMID1-205ENST00000430127 641 ntTSL 521.59■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 SNAP23-213ENST00000566327 568 ntTSL 419.59■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 SNAP23-208ENST00000563830 570 ntTSL 56.31□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 SNAP23-217ENST00000568451 573 ntTSL 46□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 SNAP23-209ENST00000563873 368 ntTSL 35.78□□□□□ -1.483e-6■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.936e-8■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.336e-8■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 NUP62CL-203ENST00000432145 688 ntAPPRIS P1 TSL 53.29□□□□□ -1.886e-8■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 36.52□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 27.6
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TARDBPQ13148 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 27.5
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TARDBPQ13148 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 27.5
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TARDBPQ13148 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 27.5
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TARDBPQ13148 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 27.5
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TARDBPQ13148 PPP4R1-220ENST00000581835 379 ntTSL 210.21□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 PPP4R1-201ENST00000285124 2917 ntTSL 59.11□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 PPP4R1-211ENST00000578875 580 ntTSL 48.7□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 PPP4R1-212ENST00000579415 563 ntTSL 48.59□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 PPP4R1-226ENST00000583903 549 ntTSL 47.52□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 PPP4R1-216ENST00000580283 378 ntTSL 26.7□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 RIOK1-201ENST00000264874 1988 ntTSL 53.25□□□□□ -1.894e-8■■■■■ 27.5
TARDBPQ13148 ZSCAN25-208ENST00000481424 5722 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 ZSCAN25-209ENST00000485586 4885 ntTSL 210.81□□□□□ -0.685e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 526.78■■□□□ 1.888e-8■■■■■ 27.4
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TARDBPQ13148 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.238e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 BRD4-210ENST00000601941 604 ntTSL 511.41□□□□□ -0.588e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 27.4
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