RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372466.8

NUP62CL-201, Transcript of nucleoporin 62 C-terminal like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP62CL, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CL-201ENST00000372466 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.58■■■□□ 2.49
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.48■■□□□ 1.83
NUP62CL-201ENST00000372466 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NUP62CL-201ENST00000372466 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.35■■□□□ 1.65
NUP62CL-201ENST00000372466 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.22■■□□□ 1.63
NUP62CL-201ENST00000372466 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.2■■□□□ 1.62
NUP62CL-201ENST00000372466 ABCC9O60706 1549 aa24.77■■□□□ 1.56
NUP62CL-201ENST00000372466 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.74■■□□□ 1.55
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NUP62CL-201ENST00000372466 NACADO15069 1562 aa24.53■■□□□ 1.52
NUP62CL-201ENST00000372466 SCRIBQ14160 1630 aa24.51■■□□□ 1.51
NUP62CL-201ENST00000372466 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.26■■□□□ 1.47
NUP62CL-201ENST00000372466 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.92■■□□□ 1.42
NUP62CL-201ENST00000372466 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
NUP62CL-201ENST00000372466 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.79■■□□□ 1.4
NUP62CL-201ENST00000372466 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.7■■□□□ 1.38
NUP62CL-201ENST00000372466 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.65■■□□□ 1.38
NUP62CL-201ENST00000372466 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.59■■□□□ 1.37
NUP62CL-201ENST00000372466 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NUP62CL-201ENST00000372466 WIZO95785 1651 aa23.56■■□□□ 1.36
NUP62CL-201ENST00000372466 SMARCA4P51532 1647 aa23.46■■□□□ 1.35
NUP62CL-201ENST00000372466 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
NUP62CL-201ENST00000372466 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.1■■□□□ 1.29
NUP62CL-201ENST00000372466 SMARCA2P51531 1590 aa23.08■■□□□ 1.29
NUP62CL-201ENST00000372466 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.04■■□□□ 1.28
NUP62CL-201ENST00000372466 TRIM41Q8WV44 630 aa22.98■■□□□ 1.27
NUP62CL-201ENST00000372466 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.94■■□□□ 1.26
NUP62CL-201ENST00000372466 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NUP62CL-201ENST00000372466 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.82■■□□□ 1.24
NUP62CL-201ENST00000372466 ABCC8Q09428 1581 aa22.75■■□□□ 1.23
NUP62CL-201ENST00000372466 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NUP62CL-201ENST00000372466 HMGXB3Q12766 1538 aa22.66■■□□□ 1.22
NUP62CL-201ENST00000372466 NCAPD3P42695 1498 aa22.64■■□□□ 1.21
NUP62CL-201ENST00000372466 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
NUP62CL-201ENST00000372466 SYNJ1O43426 1573 aa22.43■■□□□ 1.18
NUP62CL-201ENST00000372466 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.41■■□□□ 1.18
NUP62CL-201ENST00000372466 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.4■■□□□ 1.18
NUP62CL-201ENST00000372466 SOGA1O94964 1423 aa22.36■■□□□ 1.17
NUP62CL-201ENST00000372466 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP62CL-201ENST00000372466 EEA1Q15075 1411 aa22.28■■□□□ 1.16
NUP62CL-201ENST00000372466 CFTRP13569 1480 aa22.27■■□□□ 1.16
NUP62CL-201ENST00000372466 TOP2BQ02880 1626 aa22.26■■□□□ 1.15
NUP62CL-201ENST00000372466 PRDM2Q13029 1718 aa22.26■■□□□ 1.15
NUP62CL-201ENST00000372466 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.23■■□□□ 1.15
NUP62CL-201ENST00000372466 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.17■■□□□ 1.14
NUP62CL-201ENST00000372466 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.17■■□□□ 1.14
NUP62CL-201ENST00000372466 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NUP62CL-201ENST00000372466 CUX1P39880 1505 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP62CL-201ENST00000372466 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP62CL-201ENST00000372466 GOLGA3Q08378 1498 aa22.05■■□□□ 1.12
NUP62CL-201ENST00000372466 KIF21BO75037 1637 aa22.05■■□□□ 1.12
NUP62CL-201ENST00000372466 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.03■■□□□ 1.12
NUP62CL-201ENST00000372466 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NUP62CL-201ENST00000372466 CEP162Q5TB80 1403 aa22.01■■□□□ 1.11
NUP62CL-201ENST00000372466 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.01■■□□□ 1.11
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NUP62CL-201ENST00000372466 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.9■■□□□ 1.1
NUP62CL-201ENST00000372466 NESP48681 1621 aa21.89■■□□□ 1.09
NUP62CL-201ENST00000372466 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.89■■□□□ 1.09
NUP62CL-201ENST00000372466 KIF27Q86VH2 1401 aa21.84■■□□□ 1.09
NUP62CL-201ENST00000372466 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.83■■□□□ 1.09
NUP62CL-201ENST00000372466 HRCP23327 699 aa21.82■■□□□ 1.08
NUP62CL-201ENST00000372466 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.81■■□□□ 1.08
NUP62CL-201ENST00000372466 PRXQ9BXM0 1461 aa21.81■■□□□ 1.08
NUP62CL-201ENST00000372466 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.81■■□□□ 1.08
NUP62CL-201ENST00000372466 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.78■■□□□ 1.08
NUP62CL-201ENST00000372466 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NUP62CL-201ENST00000372466 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.77■■□□□ 1.08
NUP62CL-201ENST00000372466 CUX2O14529 1486 aa21.74■■□□□ 1.07
NUP62CL-201ENST00000372466 CLIP1P30622 1438 aa21.73■■□□□ 1.07
NUP62CL-201ENST00000372466 TOPBP1Q92547 1522 aa21.71■■□□□ 1.07
NUP62CL-201ENST00000372466 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.65■■□□□ 1.06
NUP62CL-201ENST00000372466 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
NUP62CL-201ENST00000372466 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NUP62CL-201ENST00000372466 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.62■■□□□ 1.05
NUP62CL-201ENST00000372466 IGF1RP08069 1367 aa21.61■■□□□ 1.05
NUP62CL-201ENST00000372466 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.61■■□□□ 1.05
NUP62CL-201ENST00000372466 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.59■■□□□ 1.05
NUP62CL-201ENST00000372466 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.58■■□□□ 1.05
NUP62CL-201ENST00000372466 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
NUP62CL-201ENST00000372466 WDR97A6NE52 1622 aa21.55■■□□□ 1.04
NUP62CL-201ENST00000372466 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NUP62CL-201ENST00000372466 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP62CL-201ENST00000372466 ARAP1Q96P48 1450 aa21.5■■□□□ 1.03
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NUP62CL-201ENST00000372466 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.42■■□□□ 1.02
NUP62CL-201ENST00000372466 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.41■■□□□ 1.02
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NUP62CL-201ENST00000372466 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.36■■□□□ 1.01
NUP62CL-201ENST00000372466 APLP2Q06481 763 aa21.35■■□□□ 1.01
NUP62CL-201ENST00000372466 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NUP62CL-201ENST00000372466 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.33■■□□□ 1
NUP62CL-201ENST00000372466 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.31■■□□□ 1
NUP62CL-201ENST00000372466 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NUP62CL-201ENST00000372466 PBRM1Q86U86 1689 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP62CL-201ENST00000372466 WDR62O43379 1518 aa21.25■□□□□ 0.99
NUP62CL-201ENST00000372466 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
NUP62CL-201ENST00000372466 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.18■□□□□ 0.98
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