Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 PSMC2-205ENST00000460021 733 ntTSL 23.46□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 CAP1-215ENST00000446031 273 ntTSL 39.97□□□□□ -0.815e-10■■■■■ 29.5
RPS3P23396 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 213.36□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 58.56□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 PHB-203ENST00000419140 907 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 29.5
RPS3P23396 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-35■■■■■ 29.5
RPS3P23396 SDHA-202ENST00000502379 679 ntTSL 221.32■■□□□ 11e-8■■■■■ 29.5
RPS3P23396 SDHA-212ENST00000509632 583 ntTSL 420.83■□□□□ 0.939e-9■■■■■ 29.5
RPS3P23396 LGALS3BP-210ENST00000588508 882 ntTSL 214.21□□□□□ -0.136e-32■■■■■ 29.5
RPS3P23396 F2-204ENST00000490274 545 ntTSL 313.26□□□□□ -0.293e-38■■■■■ 29.5
RPS3P23396 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 29.4
RPS3P23396 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 29.4
RPS3P23396 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 29.4
RPS3P23396 ECH1-212ENST00000600178 1007 ntTSL 216.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 ECH1-213ENST00000601060 786 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 CNTNAP1-204ENST00000591662 4499 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 NDUFS2-214ENST00000496133 815 ntTSL 520.98■□□□□ 0.955e-10■■■■■ 29.4
RPS3P23396 NDUFS2-215ENST00000496553 888 ntTSL 220.27■□□□□ 0.845e-10■■■■■ 29.4
RPS3P23396 NDUFS2-207ENST00000475570 506 ntTSL 219.84■□□□□ 0.775e-10■■■■■ 29.4
RPS3P23396 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.765e-10■■■■■ 29.4
RPS3P23396 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.575e-10■■■■■ 29.4
RPS3P23396 PSMC3-208ENST00000530887 891 ntTSL 217.43■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 NDUFS2-209ENST00000479948 681 ntTSL 317.25■□□□□ 0.355e-10■■■■■ 29.4
RPS3P23396 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-14■■■■■ 29.4
RPS3P23396 PSMC3-210ENST00000531051 777 ntTSL 512.38□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 PRCC-206ENST00000491853 833 ntTSL 311.96□□□□□ -0.492e-14■■■■■ 29.4
RPS3P23396 PSMC3-207ENST00000530651 905 ntTSL 511.93□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 PSMC3-204ENST00000527906 604 ntTSL 310.77□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 PRCC-205ENST00000473387 452 ntTSL 26.07□□□□□ -1.442e-14■■■■■ 29.4
RPS3P23396 NUDT21-206ENST00000568822 385 ntTSL 53.44□□□□□ -1.867e-16■■■■■ 29.4
RPS3P23396 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 LAMTOR5-202ENST00000464240 1830 ntTSL 218.65■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 29.4
RPS3P23396 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 312.98□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 29.3
RPS3P23396 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 29.3
RPS3P23396 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.671e-8■■■■■ 29.3
RPS3P23396 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 29.3
RPS3P23396 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 29.3
RPS3P23396 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.74e-9■■■■■ 29.3
RPS3P23396 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.424e-9■■■■■ 29.3
RPS3P23396 MRPS24-204ENST00000467084 729 ntTSL 214.29□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 29.3
RPS3P23396 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 29.3
RPS3P23396 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 29.3
RPS3P23396 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-13■■■■■ 29.3
RPS3P23396 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.332e-13■■■■■ 29.3
RPS3P23396 HACD3-208ENST00000566239 393 ntTSL 212.82□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 29.3
RPS3P23396 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 313.34□□□□□ -0.272e-12■■■■■ 29.3
RPS3P23396 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 29.2
RPS3P23396 LCP1-204ENST00000442275 753 ntTSL 319.13■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 29.2
RPS3P23396 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.046e-25■■■■■ 29.2
RPS3P23396 SURF4-204ENST00000465565 400 ntTSL 319.49■□□□□ 0.716e-13■■■■■ 29.2
RPS3P23396 EIF4A1-226ENST00000582848 591 ntTSL 310.71□□□□□ -0.693e-12■■■■■ 29.2
RPS3P23396 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 410.67□□□□□ -0.73e-12■■■■■ 29.2
RPS3P23396 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 36.05□□□□□ -1.443e-12■■■■■ 29.2
RPS3P23396 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.496e-8■■■■■ 29.2
RPS3P23396 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 29.2
RPS3P23396 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 29.2
RPS3P23396 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.794e-18■■■■■ 29.2
RPS3P23396 UBA1-206ENST00000442035 1054 ntTSL 520.39■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 29.2
RPS3P23396 UBA1-204ENST00000412206 1148 ntTSL 514.27□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 29.2
RPS3P23396 PCCB-211ENST00000473073 1964 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 29.2
RPS3P23396 HYOU1-202ENST00000526656 862 ntTSL 323.21■■□□□ 1.319e-12■■■■■ 29.2
RPS3P23396 C2-216ENST00000494905 536 ntTSL 413.05□□□□□ -0.325e-12■■■■■ 29.1
RPS3P23396 SURF4-201ENST00000371982 553 ntTSL 314.07□□□□□ -0.167e-10■■■■■ 29.1
RPS3P23396 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.612e-13■■■■■ 29.1
RPS3P23396 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.412e-13■■■■■ 29.1
RPS3P23396 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.372e-13■■■■■ 29.1
RPS3P23396 BANF1-204ENST00000524663 251 ntTSL 38.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.313e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.654e-15■■■■■ 29.1
RPS3P23396 SUN2-206ENST00000430185 454 ntTSL 311.3□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 29.1
RPS3P23396 ANXA1-205ENST00000468639 800 ntTSL 21.36□□□□□ -2.198e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 29.1
RPS3P23396 PAGE5-202ENST00000374952 428 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 29.1
RPS3P23396 PAGE5-203ENST00000374955 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 29.1
RPS3P23396 SF3B1-212ENST00000496458 475 ntTSL 23.23□□□□□ -1.899e-15■■■■■ 29.1
RPS3P23396 SF3B1-205ENST00000424674 723 ntTSL 42.75□□□□□ -1.979e-15■■■■■ 29.1
RPS3P23396 RUVBL2-203ENST00000594017 959 ntTSL 220.04■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 RUVBL2-202ENST00000593570 813 ntTSL 519.97■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 HMBS-212ENST00000542044 1544 ntTSL 519.3■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 P4HA2-219ENST00000478055 929 ntTSL 29.48□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 29.1
RPS3P23396 P4HA2-208ENST00000416053 582 ntTSL 36.36□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 29.1
RPS3P23396 METTL7A-205ENST00000550502 618 ntTSL 515.34■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 CES1-207ENST00000565568 659 ntTSL 514.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 29.1
RPS3P23396 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 57.09□□□□□ -1.271e-13■■■■■ 29.1
RPS3P23396 SCARB2-226ENST00000640916 689 ntTSL 27.4□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 29
RPS3P23396 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 GGCX-209ENST00000482662 720 ntTSL 310.55□□□□□ -0.725e-10■■■■■ 29
RPS3P23396 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.174e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.066e-8■■■■■ 29
RPS3P23396 MYL4-210ENST00000576874 641 ntTSL 39.61□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 29
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