RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491853.5

PRCC-206, Transcript of proline rich mitotic checkpoint control factor, humanhuman

TSL 3

Gene PRCC, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCC-206ENST00000491853 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.51■■■□□ 2.63
PRCC-206ENST00000491853 ABCC9O60706 1549 aa28.38■■■□□ 2.13
PRCC-206ENST00000491853 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.28■■■□□ 2.12
PRCC-206ENST00000491853 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.96■■□□□ 1.91
PRCC-206ENST00000491853 NACADO15069 1562 aa26.74■■□□□ 1.87
PRCC-206ENST00000491853 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.69■■□□□ 1.86
PRCC-206ENST00000491853 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.65■■□□□ 1.86
PRCC-206ENST00000491853 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
PRCC-206ENST00000491853 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.35■■□□□ 1.81
PRCC-206ENST00000491853 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.33■■□□□ 1.81
PRCC-206ENST00000491853 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.17■■□□□ 1.78
PRCC-206ENST00000491853 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PRCC-206ENST00000491853 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.98■■□□□ 1.75
PRCC-206ENST00000491853 SCRIBQ14160 1630 aa25.82■■□□□ 1.72
PRCC-206ENST00000491853 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.77■■□□□ 1.72
PRCC-206ENST00000491853 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.61■■□□□ 1.69
PRCC-206ENST00000491853 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.55■■□□□ 1.68
PRCC-206ENST00000491853 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PRCC-206ENST00000491853 NCAPD3P42695 1498 aa24.69■■□□□ 1.54
PRCC-206ENST00000491853 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.63■■□□□ 1.53
PRCC-206ENST00000491853 SMARCA4P51532 1647 aa24.6■■□□□ 1.53
PRCC-206ENST00000491853 SMARCA2P51531 1590 aa24.54■■□□□ 1.52
PRCC-206ENST00000491853 HMGXB3Q12766 1538 aa24.51■■□□□ 1.51
PRCC-206ENST00000491853 ERCC6Q03468 1493 aa24.5■■□□□ 1.51
PRCC-206ENST00000491853 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.48■■□□□ 1.51
PRCC-206ENST00000491853 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PRCC-206ENST00000491853 CUX2O14529 1486 aa24.43■■□□□ 1.5
PRCC-206ENST00000491853 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PRCC-206ENST00000491853 NESP48681 1621 aa24.37■■□□□ 1.49
PRCC-206ENST00000491853 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.33■■□□□ 1.48
PRCC-206ENST00000491853 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.29■■□□□ 1.48
PRCC-206ENST00000491853 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.15■■□□□ 1.46
PRCC-206ENST00000491853 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PRCC-206ENST00000491853 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.04■■□□□ 1.44
PRCC-206ENST00000491853 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.01■■□□□ 1.43
PRCC-206ENST00000491853 WIZO95785 1651 aa24.01■■□□□ 1.43
PRCC-206ENST00000491853 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.95■■□□□ 1.42
PRCC-206ENST00000491853 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.82■■□□□ 1.4
PRCC-206ENST00000491853 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PRCC-206ENST00000491853 WDR62O43379 1518 aa23.75■■□□□ 1.39
PRCC-206ENST00000491853 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.72■■□□□ 1.39
PRCC-206ENST00000491853 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.69■■□□□ 1.38
PRCC-206ENST00000491853 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PRCC-206ENST00000491853 CFTRP13569 1480 aa23.66■■□□□ 1.38
PRCC-206ENST00000491853 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PRCC-206ENST00000491853 TRIM41Q8WV44 630 aa23.45■■□□□ 1.34
PRCC-206ENST00000491853 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.43■■□□□ 1.34
PRCC-206ENST00000491853 PRDM2Q13029 1718 aa23.42■■□□□ 1.34
PRCC-206ENST00000491853 OSCARQ8IYS5 282 aa23.33■■□□□ 1.33
PRCC-206ENST00000491853 IFT140Q96RY7 1462 aa23.24■■□□□ 1.31
PRCC-206ENST00000491853 TOPBP1Q92547 1522 aa23.24■■□□□ 1.31
PRCC-206ENST00000491853 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PRCC-206ENST00000491853 ABCC8Q09428 1581 aa23.15■■□□□ 1.3
PRCC-206ENST00000491853 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.14■■□□□ 1.3
PRCC-206ENST00000491853 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PRCC-206ENST00000491853 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
PRCC-206ENST00000491853 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
PRCC-206ENST00000491853 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
PRCC-206ENST00000491853 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PRCC-206ENST00000491853 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.283e-8■■■■□ 26
PRCC-206ENST00000491853 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PRCC-206ENST00000491853 ARHGEF11O15085 1522 aa22.96■■□□□ 1.27
PRCC-206ENST00000491853 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.94■■□□□ 1.26
PRCC-206ENST00000491853 CHD1O14646 1710 aa22.94■■□□□ 1.26
PRCC-206ENST00000491853 FBLN2P98095 1184 aa22.9■■□□□ 1.26
PRCC-206ENST00000491853 SOGA1O94964 1423 aa22.9■■□□□ 1.26
PRCC-206ENST00000491853 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PRCC-206ENST00000491853 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.86■■□□□ 1.25
PRCC-206ENST00000491853 CUX1P39880 1505 aa22.82■■□□□ 1.24
PRCC-206ENST00000491853 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.81■■□□□ 1.24
PRCC-206ENST00000491853 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.78■■□□□ 1.24
PRCC-206ENST00000491853 WDR97A6NE52 1622 aa22.75■■□□□ 1.23
PRCC-206ENST00000491853 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PRCC-206ENST00000491853 ARAP1Q96P48 1450 aa22.73■■□□□ 1.23
PRCC-206ENST00000491853 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PRCC-206ENST00000491853 GRIN2BQ13224 1484 aa22.7■■□□□ 1.22
PRCC-206ENST00000491853 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PRCC-206ENST00000491853 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.66■■□□□ 1.22
PRCC-206ENST00000491853 SYNJ1O43426 1573 aa22.64■■□□□ 1.22
PRCC-206ENST00000491853 SYNJ2O15056 1496 aa22.62■■□□□ 1.21
PRCC-206ENST00000491853 PBRM1Q86U86 1689 aa22.62■■□□□ 1.21
PRCC-206ENST00000491853 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.61■■□□□ 1.21
PRCC-206ENST00000491853 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRCC-206ENST00000491853 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.58■■□□□ 1.21
PRCC-206ENST00000491853 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.55■■□□□ 1.2
PRCC-206ENST00000491853 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PRCC-206ENST00000491853 TOP2BQ02880 1626 aa22.44■■□□□ 1.18
PRCC-206ENST00000491853 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.44■■□□□ 1.18
PRCC-206ENST00000491853 GRIN2AQ12879 1464 aa22.41■■□□□ 1.18
PRCC-206ENST00000491853 ADAMTS12P58397 1594 aa22.39■■□□□ 1.18
PRCC-206ENST00000491853 CEP170Q5SW79 1584 aa22.33■■□□□ 1.17
PRCC-206ENST00000491853 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.33■■□□□ 1.17
PRCC-206ENST00000491853 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.32■■□□□ 1.16
PRCC-206ENST00000491853 NUP160Q12769 1436 aa22.32■■□□□ 1.16
PRCC-206ENST00000491853 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.29■■□□□ 1.16
PRCC-206ENST00000491853 SHROOM2Q13796 1616 aa22.23■■□□□ 1.15
PRCC-206ENST00000491853 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PRCC-206ENST00000491853 JPH4Q96JJ6 628 aa22.11■■□□□ 1.13
PRCC-206ENST00000491853 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.07■■□□□ 1.12
PRCC-206ENST00000491853 IGF1RP08069 1367 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.1 ms