Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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DTX3Q8N9I9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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DTX3Q8N9I9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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DTX3Q8N9I9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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DTX3Q8N9I9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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DTX3Q8N9I9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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