Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 VCP-205ENST00000479300 559 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.236e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SERPINA7-203ENST00000487487 395 ntTSL 36.93□□□□□ -1.36e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.596e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.736e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-201ENST00000264088 2056 ntTSL 1 (best)26.23■■□□□ 1.791e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-204ENST00000593600 834 ntTSL 318.26■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-206ENST00000595810 734 ntTSL 515.73■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-210ENST00000598908 888 ntTSL 314.74□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-209ENST00000598704 736 ntTSL 311.23□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-213ENST00000601760 271 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC25A23-212ENST00000601322 526 ntTSL 39.36□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 210.97□□□□□ -0.652e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.148e-11■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.018e-11■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.474e-10■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.814e-10■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TMEM138-207ENST00000539776 1635 ntTSL 25.85□□□□□ -1.474e-10■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TMEM138-211ENST00000543833 534 ntTSL 23.4□□□□□ -1.874e-10■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 EIF4G1-236ENST00000484862 590 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SEMA4G-204ENST00000484128 714 ntTSL 212.55□□□□□ -0.49e-9■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SEMA4G-203ENST00000476171 393 ntTSL 312.37□□□□□ -0.439e-9■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 ITPR2-201ENST00000242737 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 ITPR2-209ENST00000545235 540 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.923e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.924e-8■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 HDAC10-203ENST00000415993 2375 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.544e-8■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.444e-8■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.424e-8■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CYSTM1-204ENST00000509789 813 ntTSL 415.21■□□□□ 0.034e-8■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CYSTM1-202ENST00000504227 588 ntTSL 515.21■□□□□ 0.034e-8■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CYSTM1-203ENST00000509589 665 ntTSL 311.4□□□□□ -0.584e-8■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.574e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.634e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.614e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.234e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-7■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 ESPN-213ENST00000632803 455 ntTSL 322.01■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 ESPN-212ENST00000632593 506 ntTSL 221.51■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 ESPN-210ENST00000478323 270 ntTSL 521.39■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 ESPN-207ENST00000475228 813 ntTSL 519.18■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CHCHD10-203ENST00000517886 494 ntTSL 322.19■■□□□ 1.148e-9■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.148e-9■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.018e-9■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.138e-9■■■■□ 25.8
PCBP1Q15365 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.924e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.964e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.244e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 HDAC7-221ENST00000477203 3122 ntTSL 213.85□□□□□ -0.193e-7■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.413e-7■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.162e-8■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 AGAP3-207ENST00000467724 826 ntTSL 520.42■□□□□ 0.862e-8■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 AGAP3-225ENST00000498559 581 ntTSL 220.03■□□□□ 0.82e-8■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 AGAP3-213ENST00000475145 413 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-8■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 AGAP3-208ENST00000468796 540 ntTSL 49.7□□□□□ -0.862e-8■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.544e-8■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.424e-8■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 MDK-211ENST00000533283 498 ntTSL 317.1■□□□□ 0.334e-11■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.434e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-205ENST00000586817 2441 ntTSL 222.85■■□□□ 1.253e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-207ENST00000590060 1052 ntTSL 520.95■□□□□ 0.943e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-209ENST00000591767 1214 ntTSL 218.74■□□□□ 0.593e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-201ENST00000215587 1286 ntTSL 318.13■□□□□ 0.493e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-206ENST00000589737 1105 ntTSL 216.83■□□□□ 0.283e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.073e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.163e-13■■■■□ 25.7
PCBP1Q15365 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 225.1■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 517.75■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 516.88■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 415.57■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 312.3□□□□□ -0.445e-7■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 CDC20-204ENST00000482046 422 ntTSL 211.77□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 GJB1-204ENST00000447581 484 ntTSL 59.92□□□□□ -0.825e-11■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.424e-7■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.242e-10■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.142e-10■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.042e-10■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.422e-10■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-10■■■■□ 25.6
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