Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNIQ14094 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNIQ14094 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms