Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6V1E1P36543 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms