Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ATP6V1E1P36543 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP6V1E1P36543 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
ATP6V1E1P36543 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP6V1E1P36543 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP6V1E1P36543 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP6V1E1P36543 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP6V1E1P36543 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP6V1E1P36543 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP6V1E1P36543 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP6V1E1P36543 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP6V1E1P36543 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP6V1E1P36543 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP6V1E1P36543 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP6V1E1P36543 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP6V1E1P36543 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP6V1E1P36543 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP6V1E1P36543 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP6V1E1P36543 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP6V1E1P36543 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP6V1E1P36543 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP6V1E1P36543 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP6V1E1P36543 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V1E1P36543 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V1E1P36543 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V1E1P36543 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V1E1P36543 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP6V1E1P36543 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP6V1E1P36543 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP6V1E1P36543 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1E1P36543 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V1E1P36543 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP6V1E1P36543 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP6V1E1P36543 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP6V1E1P36543 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP6V1E1P36543 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP6V1E1P36543 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP6V1E1P36543 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP6V1E1P36543 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP6V1E1P36543 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP6V1E1P36543 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V1E1P36543 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V1E1P36543 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V1E1P36543 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V1E1P36543 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V1E1P36543 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V1E1P36543 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V1E1P36543 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V1E1P36543 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V1E1P36543 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V1E1P36543 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1E1P36543 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1E1P36543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1E1P36543 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP6V1E1P36543 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1E1P36543 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP6V1E1P36543 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1E1P36543 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP6V1E1P36543 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1E1P36543 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP6V1E1P36543 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP6V1E1P36543 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP6V1E1P36543 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP6V1E1P36543 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP6V1E1P36543 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP6V1E1P36543 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1E1P36543 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E1P36543 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP6V1E1P36543 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1E1P36543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP6V1E1P36543 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E1P36543 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E1P36543 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP6V1E1P36543 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1E1P36543 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP6V1E1P36543 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP6V1E1P36543 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1E1P36543 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1E1P36543 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1E1P36543 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1E1P36543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1E1P36543 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1E1P36543 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1E1P36543 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E1P36543 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP6V1E1P36543 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP6V1E1P36543 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V1E1P36543 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1E1P36543 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1E1P36543 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1E1P36543 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1E1P36543 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1E1P36543 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V1E1P36543 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP6V1E1P36543 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1E1P36543 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP6V1E1P36543 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6V1E1P36543 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP6V1E1P36543 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms