Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL4A3BPQ9Y5P4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL4A3BPQ9Y5P4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL4A3BPQ9Y5P4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COL4A3BPQ9Y5P4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL4A3BPQ9Y5P4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL4A3BPQ9Y5P4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL4A3BPQ9Y5P4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL4A3BPQ9Y5P4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL4A3BPQ9Y5P4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A3BPQ9Y5P4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms