Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRRAPQ9Y4A5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRRAPQ9Y4A5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRRAPQ9Y4A5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRRAPQ9Y4A5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRRAPQ9Y4A5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRRAPQ9Y4A5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRRAPQ9Y4A5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRRAPQ9Y4A5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRRAPQ9Y4A5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRRAPQ9Y4A5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRRAPQ9Y4A5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms