Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L5

RAP2C, Ras-related protein Rap-2c, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP2CQ9Y3L5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAP2CQ9Y3L5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAP2CQ9Y3L5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAP2CQ9Y3L5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAP2CQ9Y3L5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAP2CQ9Y3L5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAP2CQ9Y3L5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAP2CQ9Y3L5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAP2CQ9Y3L5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAP2CQ9Y3L5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAP2CQ9Y3L5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAP2CQ9Y3L5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAP2CQ9Y3L5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAP2CQ9Y3L5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAP2CQ9Y3L5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAP2CQ9Y3L5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAP2CQ9Y3L5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAP2CQ9Y3L5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms