Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP16Q9Y3C1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP16Q9Y3C1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP16Q9Y3C1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP16Q9Y3C1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOP16Q9Y3C1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOP16Q9Y3C1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP16Q9Y3C1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP16Q9Y3C1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP16Q9Y3C1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP16Q9Y3C1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOP16Q9Y3C1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOP16Q9Y3C1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NOP16Q9Y3C1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP16Q9Y3C1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms