Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7AQ9Y3A4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7AQ9Y3A4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RRP7AQ9Y3A4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRP7AQ9Y3A4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRP7AQ9Y3A4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RRP7AQ9Y3A4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRP7AQ9Y3A4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7AQ9Y3A4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7AQ9Y3A4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRP7AQ9Y3A4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRP7AQ9Y3A4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RRP7AQ9Y3A4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RRP7AQ9Y3A4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RRP7AQ9Y3A4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RRP7AQ9Y3A4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRP7AQ9Y3A4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
RRP7AQ9Y3A4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RRP7AQ9Y3A4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRP7AQ9Y3A4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRP7AQ9Y3A4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRP7AQ9Y3A4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7AQ9Y3A4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7AQ9Y3A4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7AQ9Y3A4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRP7AQ9Y3A4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRP7AQ9Y3A4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms