Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3M1Q9Y2T2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3M1Q9Y2T2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M1Q9Y2T2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M1Q9Y2T2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M1Q9Y2T2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M1Q9Y2T2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP3M1Q9Y2T2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms