Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1DQ9Y2S0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1DQ9Y2S0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1DQ9Y2S0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1DQ9Y2S0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1DQ9Y2S0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1DQ9Y2S0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1DQ9Y2S0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1669.7 ms