Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ICE1Q9Y2F5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ICE1Q9Y2F5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ICE1Q9Y2F5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ICE1Q9Y2F5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ICE1Q9Y2F5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ICE1Q9Y2F5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ICE1Q9Y2F5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ICE1Q9Y2F5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ICE1Q9Y2F5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ICE1Q9Y2F5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms