Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HDAC5Q9UQL6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
HDAC5Q9UQL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HDAC5Q9UQL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HDAC5Q9UQL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HDAC5Q9UQL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDAC5Q9UQL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HDAC5Q9UQL6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDAC5Q9UQL6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDAC5Q9UQL6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDAC5Q9UQL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HDAC5Q9UQL6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDAC5Q9UQL6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HDAC5Q9UQL6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HDAC5Q9UQL6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HDAC5Q9UQL6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HDAC5Q9UQL6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HDAC5Q9UQL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
HDAC5Q9UQL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HDAC5Q9UQL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HDAC5Q9UQL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HDAC5Q9UQL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
HDAC5Q9UQL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HDAC5Q9UQL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
HDAC5Q9UQL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HDAC5Q9UQL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HDAC5Q9UQL6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HDAC5Q9UQL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDAC5Q9UQL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HDAC5Q9UQL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HDAC5Q9UQL6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms