Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQK1

PPP1R3C, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3CQ9UQK1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3CQ9UQK1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3CQ9UQK1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3CQ9UQK1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R3CQ9UQK1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3CQ9UQK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3CQ9UQK1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3CQ9UQK1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R3CQ9UQK1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R3CQ9UQK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3CQ9UQK1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3CQ9UQK1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms