Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCA2Q9UQC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCA2Q9UQC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCA2Q9UQC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCA2Q9UQC9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCA2Q9UQC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCA2Q9UQC9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCA2Q9UQC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCA2Q9UQC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCA2Q9UQC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA2Q9UQC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCA2Q9UQC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms