Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NEU3Q9UQ49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEU3Q9UQ49 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEU3Q9UQ49 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEU3Q9UQ49 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEU3Q9UQ49 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEU3Q9UQ49 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEU3Q9UQ49 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEU3Q9UQ49 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEU3Q9UQ49 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms