Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEU3Q9UQ49 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEU3Q9UQ49 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NEU3Q9UQ49 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEU3Q9UQ49 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEU3Q9UQ49 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEU3Q9UQ49 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEU3Q9UQ49 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEU3Q9UQ49 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEU3Q9UQ49 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEU3Q9UQ49 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEU3Q9UQ49 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEU3Q9UQ49 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEU3Q9UQ49 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEU3Q9UQ49 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEU3Q9UQ49 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEU3Q9UQ49 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEU3Q9UQ49 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEU3Q9UQ49 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEU3Q9UQ49 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEU3Q9UQ49 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEU3Q9UQ49 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEU3Q9UQ49 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEU3Q9UQ49 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEU3Q9UQ49 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEU3Q9UQ49 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEU3Q9UQ49 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEU3Q9UQ49 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEU3Q9UQ49 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEU3Q9UQ49 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEU3Q9UQ49 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEU3Q9UQ49 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEU3Q9UQ49 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEU3Q9UQ49 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEU3Q9UQ49 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEU3Q9UQ49 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEU3Q9UQ49 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEU3Q9UQ49 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEU3Q9UQ49 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEU3Q9UQ49 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEU3Q9UQ49 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEU3Q9UQ49 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEU3Q9UQ49 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEU3Q9UQ49 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEU3Q9UQ49 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEU3Q9UQ49 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEU3Q9UQ49 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEU3Q9UQ49 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEU3Q9UQ49 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEU3Q9UQ49 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEU3Q9UQ49 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEU3Q9UQ49 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NEU3Q9UQ49 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEU3Q9UQ49 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEU3Q9UQ49 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEU3Q9UQ49 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEU3Q9UQ49 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEU3Q9UQ49 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEU3Q9UQ49 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEU3Q9UQ49 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEU3Q9UQ49 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEU3Q9UQ49 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEU3Q9UQ49 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEU3Q9UQ49 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEU3Q9UQ49 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEU3Q9UQ49 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEU3Q9UQ49 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEU3Q9UQ49 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEU3Q9UQ49 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEU3Q9UQ49 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NEU3Q9UQ49 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEU3Q9UQ49 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEU3Q9UQ49 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEU3Q9UQ49 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NEU3Q9UQ49 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NEU3Q9UQ49 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEU3Q9UQ49 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEU3Q9UQ49 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEU3Q9UQ49 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEU3Q9UQ49 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEU3Q9UQ49 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEU3Q9UQ49 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEU3Q9UQ49 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEU3Q9UQ49 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEU3Q9UQ49 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEU3Q9UQ49 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEU3Q9UQ49 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEU3Q9UQ49 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEU3Q9UQ49 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEU3Q9UQ49 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEU3Q9UQ49 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEU3Q9UQ49 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEU3Q9UQ49 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEU3Q9UQ49 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEU3Q9UQ49 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEU3Q9UQ49 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NEU3Q9UQ49 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEU3Q9UQ49 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEU3Q9UQ49 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEU3Q9UQ49 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms