Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PDZRN3Q9UPQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDZRN3Q9UPQ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDZRN3Q9UPQ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDZRN3Q9UPQ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PDZRN3Q9UPQ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PDZRN3Q9UPQ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PDZRN3Q9UPQ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PDZRN3Q9UPQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDZRN3Q9UPQ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
PDZRN3Q9UPQ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms