Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT6Q9ULM6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT6Q9ULM6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6Q9ULM6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT6Q9ULM6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT6Q9ULM6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT6Q9ULM6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT6Q9ULM6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT6Q9ULM6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT6Q9ULM6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CNOT6Q9ULM6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms