Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKLN1Q9UL63 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKLN1Q9UL63 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKLN1Q9UL63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKLN1Q9UL63 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKLN1Q9UL63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKLN1Q9UL63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKLN1Q9UL63 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKLN1Q9UL63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKLN1Q9UL63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKLN1Q9UL63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKLN1Q9UL63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKLN1Q9UL63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKLN1Q9UL63 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKLN1Q9UL63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKLN1Q9UL63 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms