Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C4Q9UKN8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C4Q9UKN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C4Q9UKN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF3C4Q9UKN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C4Q9UKN8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C4Q9UKN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C4Q9UKN8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C4Q9UKN8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C4Q9UKN8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C4Q9UKN8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C4Q9UKN8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF3C4Q9UKN8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C4Q9UKN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C4Q9UKN8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4Q9UKN8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms