Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPREB3Q9UKI3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPREB3Q9UKI3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPREB3Q9UKI3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VPREB3Q9UKI3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPREB3Q9UKI3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms