Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTBP2Q9UKA9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTBP2Q9UKA9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTBP2Q9UKA9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTBP2Q9UKA9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTBP2Q9UKA9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTBP2Q9UKA9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTBP2Q9UKA9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTBP2Q9UKA9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTBP2Q9UKA9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTBP2Q9UKA9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTBP2Q9UKA9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTBP2Q9UKA9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTBP2Q9UKA9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTBP2Q9UKA9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTBP2Q9UKA9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTBP2Q9UKA9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTBP2Q9UKA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTBP2Q9UKA9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTBP2Q9UKA9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTBP2Q9UKA9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTBP2Q9UKA9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTBP2Q9UKA9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTBP2Q9UKA9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTBP2Q9UKA9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTBP2Q9UKA9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTBP2Q9UKA9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTBP2Q9UKA9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTBP2Q9UKA9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTBP2Q9UKA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTBP2Q9UKA9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTBP2Q9UKA9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms