Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PLXNA1Q9UIW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PLXNA1Q9UIW2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PLXNA1Q9UIW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PLXNA1Q9UIW2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PLXNA1Q9UIW2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLXNA1Q9UIW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PLXNA1Q9UIW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PLXNA1Q9UIW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PLXNA1Q9UIW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLXNA1Q9UIW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLXNA1Q9UIW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLXNA1Q9UIW2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PLXNA1Q9UIW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLXNA1Q9UIW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PLXNA1Q9UIW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PLXNA1Q9UIW2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms