Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATPIF1Q9UII2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATPIF1Q9UII2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATPIF1Q9UII2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATPIF1Q9UII2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATPIF1Q9UII2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATPIF1Q9UII2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATPIF1Q9UII2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms