Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF639Q9UID6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF639Q9UID6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF639Q9UID6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF639Q9UID6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF639Q9UID6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF639Q9UID6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF639Q9UID6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF639Q9UID6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF639Q9UID6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF639Q9UID6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF639Q9UID6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF639Q9UID6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF639Q9UID6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF639Q9UID6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF639Q9UID6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF639Q9UID6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF639Q9UID6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF639Q9UID6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF639Q9UID6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF639Q9UID6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF639Q9UID6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF639Q9UID6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF639Q9UID6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF639Q9UID6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms