Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1BQ9UEU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VTI1BQ9UEU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTI1BQ9UEU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VTI1BQ9UEU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTI1BQ9UEU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTI1BQ9UEU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1BQ9UEU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VTI1BQ9UEU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VTI1BQ9UEU0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VTI1BQ9UEU0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1BQ9UEU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1BQ9UEU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTI1BQ9UEU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms