Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM8A1Q9UBU6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM8A1Q9UBU6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM8A1Q9UBU6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM8A1Q9UBU6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM8A1Q9UBU6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM8A1Q9UBU6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM8A1Q9UBU6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM8A1Q9UBU6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM8A1Q9UBU6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM8A1Q9UBU6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM8A1Q9UBU6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms