Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGFRNQ9P2B2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGFRNQ9P2B2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGFRNQ9P2B2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGFRNQ9P2B2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGFRNQ9P2B2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGFRNQ9P2B2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGFRNQ9P2B2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGFRNQ9P2B2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGFRNQ9P2B2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGFRNQ9P2B2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGFRNQ9P2B2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGFRNQ9P2B2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGFRNQ9P2B2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGFRNQ9P2B2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGFRNQ9P2B2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGFRNQ9P2B2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGFRNQ9P2B2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms