Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRD1Q9P1U0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRD1Q9P1U0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRD1Q9P1U0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRD1Q9P1U0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRD1Q9P1U0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms